建模与结构搭建
晶体、聚合物、表面界面与纳米结构;空间群超胞、切面吸附构型、Amorphous Cell 无定形建模的思路与避坑。
履历 · BACKGROUND
研究生阶段用分子动力学啃水化硅酸钙(C-S-H)凝胶的碳纳米管改性,从此习惯了在终端里 和不收敛、报错、诡异的输入文件较劲。后来在东方科软做 BIOVIA 材料科学技术工程师, 每天的工作就是把 Materials Studio 里各种真实计算问题,讲清楚、答明白。
比起把参数调出一个数,我更在意把背后的物理与方法讲透。这些年我不想只做 又一个跑算例的人把方法沉淀下来的人—— 既给社区写知识,也直接把这套能力,用在别人的课题与项目上。

战绩 · BY THE NUMBERS
专长 · WHAT I DO
晶体、聚合物、表面界面与纳米结构;空间群超胞、切面吸附构型、Amorphous Cell 无定形建模的思路与避坑。
力场选择与电荷分配、系综与控温控压、平衡判据;均方位移、扩散系数、相互作用能的正确计算与解读。
赝势与泛函选择、k 点与截断能收敛测试、几何优化与能带态密度的参数设定与精度把控。
吸附、扩散、膜分离、力学与光电性质的方案设计;从模拟结果反推机理,接回真实的材料研发问题。
Pipeline Pilot 流程搭建、Python 批量计算与后处理,把重复的收敛、建模与分析一键化、可复现。
计算不收敛、任务报错、结果异常的定位排查;帮你判断结果是否可信、图该怎么读、结论该怎么写。
需要这些支持?页眉的「联系我们」随时找我,通常 48 小时内回复。
方法示例 · HOW I EXPLAIN
以「多孔介质 / 纳米孔岩石」为例——从导入晶体、挖孔、表面钝化到组装流体与边界,每一步都可复现、可脚本化。点击看大图。
科研轨迹 · TRACK RECORD
论文、致谢与公开分享,按真实时序串在一条线上——这也是我理解与讲解分子模拟方法的来路。
你正在浏览的这个材料计算知识社区——从架构、检索到内容体系,由我主导搭建并持续运营与答疑。
金属有机框架自适应「角袋」孔道设计,实现乙炔高吸附容量、超快扩散与高选择性的协同——分子模拟支撑前沿气体存储的代表作。
查看原文解读 Martini 3 粗粒化、CASTEP 色散校正、Python 脚本计算两层结构相互作用能与用户菜单自动化等更新。
DFT 与 MD 联用,阐明金属取代 MOF-74 对姜黄素(药物分子)的吸附动力学与机理;本人承担 Validation / Methodology / Data curation。
查看原文以 DFT 计算解释多羟基蒽衍生物对氟离子的选择性识别机制,呈现实验与计算互证的研究范式。
查看原文围绕驱油、纳米孔膜过滤、气体渗透与离子输运等受限空间输运分离过程,讲自动化建模与分析方法。
聚焦 Materials Studio 计算流程自动化、参数收敛测试与可复现计算实践。
以分子模拟揭示 ZIF-90 膜对天然气脱水的输运与分离机制;论文致谢具名东方科软工程师 Pengbo Duanmu 的 technical support。
查看原文第二十二期「达索观点」在线直播,系统讲分子模拟在油田化学与催化炼化场景的落地路径并答疑。
中原工学院硕士论文,用分子动力学研究水化硅酸钙凝胶在碳纳米管改性下的界面作用与力学响应,涉及 C-S-H 凝胶、径向分布函数等——理解「建模—计算—解读」全流程的起点。
查看原文作者列出 Pengbo DuanMu,发表时间与硕士阶段吻合,作为该时期英文署名候选项保留(机构闭环待核验)。
查看原文作者列表包含 Pengbo Duanmu,主题为电化学—高锰酸盐体系对尿液中药物的降解,作为同名英文署名线索保留并标注核验边界。
查看原文论文均以 Pengbo Duanmu 署名或在致谢中具名,机构线索(Dongfang Keruan / 东方科软)与本人一致,可公开核验;更多可见 科学网个人主页 →
署名 / 收录期刊 · PUBLISHED IN
文献图选 · FROM THE PAPERS
下列图像均直接引用自参与论文的开放获取(Open Access)原文,用于展示在分子模拟与第一性原理计算上的实际产出,逐图标注来源。
初心 · WHY I BUILT THIS
做计算材料的人,大多在各自的终端里,独自和报错搏斗。同样的不收敛、同样的任务报错、 同样的输入文件陷阱,被反复踩中,又被反复遗忘。
所以我做了 AtomSpace——一本所有研究者都能写、都能查、能互相批注的公共实验记录本。 你今天的一次排错记录,可能就是别人明天的救命答案。把它做好,本身就是我最想交出的作品。
联系 · LET'S TALK
课题卡在建模、参数或报错上,项目想找人把计算方案落地,或者你也在做材料模拟想交流——都欢迎来聊。