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关于站长 · ABOUT THE FOUNDER

端木鹏博

端木鹏博

Pengbo Duanmu

Materials Studio 问答站站长 · 计算材料学博士在读

  • 计算材料学
  • 博士在读
  • Materials Studio
  • CASTEP / DMol3
  • Forcite 分子动力学
  • Pipeline Pilot · Python

长期深耕 Materials Studio 生态——从建模、力场与第一性原理参数设置,到批量计算、收敛测试与结果解读。方法实力由 Angewandte Chemie、ACS Omega、Scientific Reports 等国际期刊的公开署名背书,也乐意把这套能力,直接用在你的课题与项目上。

收敛测试 · CONVERGENCE
误差 / 能量迭代步数 →收敛

把复杂的模拟,一步步收敛成一个能讲清楚的答案。

履历 · BACKGROUND

一个把计算当手艺打磨的人

研究生阶段用分子动力学啃水化硅酸钙(C-S-H)凝胶的碳纳米管改性,从此习惯了在终端里 和不收敛、报错、诡异的输入文件较劲。后来在东方科软做 BIOVIA 材料科学技术工程师, 每天的工作就是把 Materials Studio 里各种真实计算问题,讲清楚、答明白。

比起把参数调出一个数,我更在意把背后的物理与方法讲透。这些年我不想只做 又一个跑算例的人把方法沉淀下来的人—— 既给社区写知识,也直接把这套能力,用在别人的课题与项目上。

  • 学历计算材料学 博士在读 · 中原工学院 工学硕士(2021)
  • 方向第一性原理计算 · 分子动力学 · MOF 吸附分离 / 膜过滤气体输运 / 功能分子光电与离子识别
  • 经历曾任东方科软(BIOVIA 体系)材料科学技术工程师 / 高级技术工程师
  • 擅长Materials Studio · Forcite · CASTEP · DMol3 · Pipeline Pilot · Python

战绩 · BY THE NUMBERS

用数字说话

国际期刊署名 · PAPERS
4+
MS 实战答疑 · YEARS
8 年
答疑方向 · TOPICS
6 大
公开分享直播 · TALKS
4 场
计算软件栈 · TOOLS
6+
硕士学位论文 · THESIS
2021

专长 · WHAT I DO

我擅长、也能帮你做这些

建模与结构搭建

晶体、聚合物、表面界面与纳米结构;空间群超胞、切面吸附构型、Amorphous Cell 无定形建模的思路与避坑。

力场与 Forcite 分子动力学

力场选择与电荷分配、系综与控温控压、平衡判据;均方位移、扩散系数、相互作用能的正确计算与解读。

CASTEP / DMol3 第一性原理

赝势与泛函选择、k 点与截断能收敛测试、几何优化与能带态密度的参数设定与精度把控。

性质与机理计算

吸附、扩散、膜分离、力学与光电性质的方案设计;从模拟结果反推机理,接回真实的材料研发问题。

自动化与脚本

Pipeline Pilot 流程搭建、Python 批量计算与后处理,把重复的收敛、建模与分析一键化、可复现。

报错排查与结果解读

计算不收敛、任务报错、结果异常的定位排查;帮你判断结果是否可信、图该怎么读、结论该怎么写。

需要这些支持?页眉的「联系我们」随时找我,通常 48 小时内回复。

方法示例 · HOW I EXPLAIN

一个建模流程,我会这样拆开讲

以「多孔介质 / 纳米孔岩石」为例——从导入晶体、挖孔、表面钝化到组装流体与边界,每一步都可复现、可脚本化。点击看大图。

方法示例 · 导入晶体 → 挖孔 → 表面钝化 → 组装流体与边界

科研轨迹 · TRACK RECORD

一条从 2021 走到现在的计算轨迹

论文、致谢与公开分享,按真实时序串在一条线上——这也是我理解与讲解分子模拟方法的来路。

  1. 持续
    主理平台主理 · 在线平台

    AtomSpace(本站)

    你正在浏览的这个材料计算知识社区——从架构、检索到内容体系,由我主导搭建并持续运营与答疑。

  2. 2026
    学术论文作者署名 · MOF

    Angewandte Chemie (2026) · 乙炔超快扩散与储存

    金属有机框架自适应「角袋」孔道设计,实现乙炔高吸附容量、超快扩散与高选择性的协同——分子模拟支撑前沿气体存储的代表作。

    查看原文
    公开分享官方版本解读

    Materials Studio 2026 版本更新亮点

    解读 Martini 3 粗粒化、CASTEP 色散校正、Python 脚本计算两层结构相互作用能与用户菜单自动化等更新。

  3. 2025
    学术论文作者署名 · DFT+MD

    Scientific Reports (2025) · 姜黄素在 MOF-74 的吸附机理

    DFT 与 MD 联用,阐明金属取代 MOF-74 对姜黄素(药物分子)的吸附动力学与机理;本人承担 Validation / Methodology / Data curation。

    查看原文
    学术论文作者署名 · DFT

    ACS Omega (2025) · 氟离子选择性识别

    以 DFT 计算解释多羟基蒽衍生物对氟离子的选择性识别机制,呈现实验与计算互证的研究范式。

    查看原文
    公开分享公开分享

    基于 Forcite 的分子动力学自动化模拟

    围绕驱油、纳米孔膜过滤、气体渗透与离子输运等受限空间输运分离过程,讲自动化建模与分析方法。

    公开分享直播

    一键自动化!CASTEP 参数收敛测试不再是难题

    聚焦 Materials Studio 计算流程自动化、参数收敛测试与可复现计算实践。

  4. 2024
    学术论文技术支持致谢

    Nanomaterials (2024) · ZIF-90 膜天然气脱水

    以分子模拟揭示 ZIF-90 膜对天然气脱水的输运与分离机制;论文致谢具名东方科软工程师 Pengbo Duanmu 的 technical support。

    查看原文
    公开分享达索观点 · 云讲堂

    分子模拟在油田化学与催化炼化中的应用

    第二十二期「达索观点」在线直播,系统讲分子模拟在油田化学与催化炼化场景的落地路径并答疑。

  5. 2021
    学术论文研究底色 · 分子动力学

    硕士学位论文 (2021) · 碳纳米管改性 C-S-H 凝胶

    中原工学院硕士论文,用分子动力学研究水化硅酸钙凝胶在碳纳米管改性下的界面作用与力学响应,涉及 C-S-H 凝胶、径向分布函数等——理解「建模—计算—解读」全流程的起点。

    查看原文
    学术论文同期署名 · 待核验

    Dalton Transactions (2021) · 多彩防伪长余辉磷光体

    作者列出 Pengbo DuanMu,发表时间与硕士阶段吻合,作为该时期英文署名候选项保留(机构闭环待核验)。

    查看原文
    学术论文同期署名 · 待核验

    Water (2021) · 微生物燃料电池降解双氯芬酸

    作者列表包含 Pengbo Duanmu,主题为电化学—高锰酸盐体系对尿液中药物的降解,作为同名英文署名线索保留并标注核验边界。

    查看原文

论文均以 Pengbo Duanmu 署名或在致谢中具名,机构线索(Dongfang Keruan / 东方科软)与本人一致,可公开核验;更多可见 科学网个人主页 →

署名 / 收录期刊 · PUBLISHED IN

文献图选 · FROM THE PAPERS

一些真实的计算工作

下列图像均直接引用自参与论文的开放获取(Open Access)原文,用于展示在分子模拟与第一性原理计算上的实际产出,逐图标注来源。

初心 · WHY I BUILT THIS

为什么有 AtomSpace

做计算材料的人,大多在各自的终端里,独自和报错搏斗。同样的不收敛、同样的任务报错、 同样的输入文件陷阱,被反复踩中,又被反复遗忘。

所以我做了 AtomSpace——一本所有研究者都能写、都能查、能互相批注的公共实验记录本。 你今天的一次排错记录,可能就是别人明天的救命答案。把它做好,本身就是我最想交出的作品。

联系 · LET'S TALK

想做点什么,或只是想认识一下

课题卡在建模、参数或报错上,项目想找人把计算方案落地,或者你也在做材料模拟想交流——都欢迎来聊。